百花山国家级自然保护区地处北京西部，位于北京市门头沟区清水镇境内，2008年经国务院批准在北京百花山自然保护区基础上晋升为国家级自然保护区。
保护区是以保护暖温带华北石质山地次生落叶阔叶林生态系统为主的自然保护区，总面积为21743.1公顷。

1985年，北京市人民政府批建成立了“北京百花山自然保护区”，为省市级自然保护区。

2008年1月，国务院批准百花山保护区晋升为国家级自然保护区。

【地形地貌】
区中北部及西南部为山地侵蚀构造地貌，约占全区面积的90%，地势陡峻，河流下切深；东南部为侵蚀构造地貌或堆积地貌，占全区面积的10%左右，地势较平缓，并发育宽浅河谷。
保护区大部分区域海拔在750－2200米之间。最高峰为东灵山，海拔2303米，是北京第一高峰；区域内百花山海拔1991米，为北京第三高峰。山坡坡度多在30度以上。

*** 水文
百花山保护区内自海拔900－2000米处均有清泉分布；百花山属海河水系，是永定河流域清水河的一个源头。

*** 植被
百花山自然保护区地带性植被为暖温带落叶阔叶林，在天然植被的植物种类组成中，有热带亲缘植物（蕨类、猕猴桃等），也有寒带亲缘植物（核桃楸、毛榛、锦带花等）。
森林植被垂直分异明显，可分四带：（1）海拔1000～1200米之间以油松林、栎类林和油松栎类混交林为主；（2）海拔1200～1600米之间以山杨林、桦树林为主；（3）海拔1600～1900米之间以云杉、华北落叶松林和云杉桦树针阔叶混交林为主；（4）海拔1900米以上的山脊、山顶则是亚高山草甸。

【保护区范围】

栏山海拔500米为起点，向东南沿山脊线到百花山主峰海拔1991米，沿门头沟区和房山区行政区界至门头沟区与房山区交界最高峰白草畔2043米山峰；西从北京市与河北省涞水县交界处的全树塔起，向北沿北京市与河北省涿鹿县、怀来县省界，至北京市门头沟区清水镇与怀来县交界处的1922米山峰，再沿山脊线经门头沟区清水镇与斋堂镇行政交界线至马栏林场。
保护区总面积为21743.1公顷。其中，核心区面积6836公顷，缓冲区面积4880.64公顷，实验区面积10026.46公顷。

【旅游资源】
百花山的风景资源分为百花山主峰景区、百花草甸景区、望海楼景区、百草畔景区四大景区。
有“百花草畔”、“百花山瀑布”、“万年冰肌”、“古树擎天”、“云顶日出”、“冰壁岩柱”、“冰缘城堡”、“云海升腾”、“晚霞映翠”、“七色玉带”、“金蟾拜月”、“蚂蚁山”、“白莽长啸”、“松树长廊”等十八处独特景观、35个景点。

保护区内有“古石海”、“冰缘城堡”、“冰壁岩柱”等，是地质变迁的历史遗迹，为晚更新世和全新世早期寒冷条件下形成的。
有“天然长城”、“母子石”、“震山石—锦簇攒天”东梁的“驼峰”及“文殊像”等典型的地质结构景观、地质剖面景观、火山熔岩景观。
历史人文景观有五代时期后唐李克用作战时曾在此建过的亭子；明代建有龙王庙、瑞云寺等庙宇，庙宇遗址尚存。

【公交路线】
苹果园地铁站西边乘892路公交车到达百花山（黄塔张家铺方向）。每天早9：00和下午4：30共两趟。
房山长途汽车站可乘房20路，房25路到龙门台村，车程2小时。车次不多，末班15:45。

【自驾路线】
1. 房山区入口：
京石高速路至房山出口——坨里——108国道——贾峪口路口右转弯去史家营方向即到（门票60元）。

2. 门头沟入口：
走109国道是从门头沟方向进入景区，到达的地点就是张家铺（门票40元）。

3. 白草畔景区入口：
走108国道至贾峪口不右转，一直到龙门台村，再往北到四马台村，沿着路一直开就能到四马台村的景区入口。这边叫白草畔，也叫房山世界地质公园，到景区门口后坐景区观光车（40元，往返），走15公里左右到达山顶的五指峰，然后有通往大草甸的木栈道，走1小时左右到大草甸，是能上到草甸最轻松的方式。

【驴友攻略参考】
这里指门头沟百花山自然风景区，之所以这么说是因为在房山区还存在着另一个叫百花山自然保护区的山头，二者相距不远，后者才真正拥有百花山海拔1991米的主峰。无论从哪里上山，都会走到同一个高山草甸中，显然，这两个景区实际是同一座山的不同入口而已。

很奇妙，这座山真的很有戏剧性，当从草甸继续向上爬升时，很快会进入第三个景区，房山白草畔风景区，
房山百草畔的主峰是海拔2035米的五指峰。从这个景区上来后就是它了。

百花山在房山区有两个入口：
一个是沿108国道经史家营乡上来的百花山自然保护区，门票60元，开车可以直达主峰，登顶后向西南方向可以到达大草甸。
另一个是沿108国道经霞云岭乡四马台村上来的白草畔景区，门票40元，需要换乘景区内部的观光车登顶，车票也是40元，可直达五指峰，这里也是北京地区惟一能乘车直达2000多米高峰的旅游景点。登顶后向东北方面可以到达大草甸。

【爬山趣登顶打卡点】百花山主峰，最高处。